코로나19(COVID-19) 대응 - 팬데믹 기간 중 백신 및 치료제 관련 연구를 위한 지원을 아끼지 않고 있습니다. 자세히 알아보기 

시간당 최대 3,000개의 콜로니를 픽업할 수 있는 자동화된 미생물 스크리닝 시스템

 

QPix® 미생물 콜로니 피커는 동급 최강의 콜로니 피킹 기술을 활용하여 병목 현상을 완화하고 방대한 유전자 라이브러리를 빠르고 정확하고 효율적으로 Screening합니다. 사용하기 쉬우며 직관적인 소프트웨어는 사용자가 정밀한 로봇으로 매번 알맞은 콜로니를 피킹할 수 있는 콜로니 피킹 실행을.. 미생물 스크리닝 이외에도, 이 시스템은 박테리아 액상 배양 및 한천배지에서의 플레이팅 등 여러 샘플 준비 및 플레이트 취급 과정을 자동화합니다. 

데이터는 자동으로 기계의 데이터베이스에 기록되어 사용자에게 완전한 감사 추적과 샘플 추적을 제공하여 데이터가 손실되지 않도록 합니다. 확장 가능한 모듈식 콜로니 피커 시리즈를 사용하면 모든 크기의 샘플에 대한 실험과정의 정확도와 처리량을 높이는 동시에 추가적인 처리량 증가가 가능합니다.

  • 너비 아이콘

    원하는 표현형을 이용한 콜로니 식별

    QPix 콜로니 피커는 다양한 종류의 미생물 및 형광의 세기, 청색/백색 선택, 크기 및 근접성, 억제영역을 포함한 다중 선택 양식을 지원합니다.

  • 선택하기 아이콘

    효율적인 콜로니 선택

    유기체 특이적 핀과 한천배지 센서 제품군은 효율적인 피킹을 보장합니다. 이 시스템은 98%를 초과하는 피킹 효율성을 제공하여 계속 대기하지 않아도 안심할 수 있도록 합니다.

  • 멸균 아이콘

    멸균 유지관리

    기기 내부의 위생처리, 핀 세척, 핀의 할로겐 건조를 위한 UV 광선을 포함한 멸균 기능을 사용할 수 있습니다.

QPix 시스템의 해부학

기능

  • 효율적 아이콘

    유기체 특이적 핀

    서로 다른 모양과 피킹 영역 핀으로 E. coli, 파지, 효모에 대한 효율성을 극대화합니다. 플레이팅 특이적 핀은 한천배지에 액체 배양액이 균일하게 분포하도록 합니다.

  • 다중 선택 아이콘

    다양한 이미징 모드

    Colony는 백색광, 형광, 색을 이용하여 사전에 지정된 Parameter를 기반으로 피킹할 수 있습니다. 필터의 사용은 청색-백색 Colony 스크리닝과 같은 응용 작업이 가능하게 합니다.

  • 시간 절약 아이콘

    플레이팅과 스프레딩

    샘플 96개의 자동화 플레이팅 및 선상도말법은 30분 이내에 완료되므로, 대기 시간을 줄여줍니다.

  • 간소화 아이콘

    복제, 그리드 및 유효물질 피킹

    자동화 플레이트 취급 및 추적으로 다운스트림 assay와 샘플 관리를 간소화할 수 있습니다. QPix 콜로니 피커는 유연한 플레이트 복제, 그리딩, 유효물질 피킹 기능을 제공합니다.

  • 효율적 아이콘

    한천배지 감지

    한천배지의 초음파 높이 센서는 최대 피킹 효율에 도달하도록 하는 다양한 주입량으로 인한 높이의 차이를 감지합니다.

  • 자동화 아이콘

    규모 조절이 가능한 자동화 옵션*

    QPix HT 모델은 모듈식 덱이 있는 로봇 호환 솔루션입니다. 고급 워크플로 엔지니어링 솔루션 팀은 다양한 고객 서비스를 통해 콜로니 피커를 맞춤화할 수 있습니다.

*가격, 배송 기간, 사양은 상호간에 동의한 기술적 요구 사항에 따라 달라집니다. 솔루션 요구 사항으로 인해 표준 성능이 조정될 수 있습니다.

QPix 콜로니 피커를 사용한 실험과정의 자동화

콜로니 피킹은 생물학적 연구에서 필수적인 단계입니다. 과학자들은 DNA 또는 단백질을 대량 생산하여 다양한 응용 분야의 다운스트림에 사용하기 위해 미생물 클론을 종종 분리합니다. 일반적으로, 콜로니 피킹은 멸균 상태의 피펫 팁, 접종 루프를 사용하여 수동으로 실시하며, 보통 느리고, 노동집약적이며 시간이 많이 듭니다. 자동화 콜로니 피커는 전체 과정을 더 빠르게 만들 뿐만 아니라, 결과 또한 더 일관적이고 신뢰할 수 있습니다.

IMAGING
피킹 용량
Colony Selection 기준
피킹과 영역 피킹
바코드 추적
재배열과 복제
그리딩
플레이팅과 선상도말법
한천 플레이트에서 한천 플레이트로 이동
로봇 통합
교반 배양기
액체 구동기
PCR
밀봉기/필러
ELISA
대상 플레이트 용량
Stacker
소스 플레이트 용량
워크어웨이 시간

좁은 설치 공간의 콜로니 피킹 자동화를 위한 기본 설계 수동 방식을 자동 피킹으로 대체하는 이상적인 시스템으로 유연한 베드 설치와 실험실 도구 사용이 가능합니다.

플레이팅에서 피킹까지 – Stacker 레인 3개에 최대 210개 대상 플레이트를 포함하여 샘플처리량의 증가 플레이팅과 선상도말법을 위한 유체 옵션으로 샘플을 플레이팅하고 피킹할 수 있도록 합니다.

유연한 모듈식 완전 자동화 콜로니 피킹과 라이브러리 관리 시스템으로 최대 처리량과 워크어웨이 시간을 위한 로봇 통합이 준비되어 있습니다.

백생광과 형광

백생광과 형광

백생광과 형광

백색광에서 시간당 콜로니 3000개, 형광에서 시간당 콜로니 2000개

백색광에서 시간당 콜로니 3000개, 형광에서 시간당 콜로니 2000개

백색광에서 시간당 콜로니 3000개, 형광에서 시간당 콜로니 2000개

크기, 근접성, 원형성, 형광의 세기

크기, 근접성, 원형성, 형광의 세기

크기, 근접성, 원형성, 형광의 세기

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QPix 460 전용

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피킹: 12 plates
Replicating and re-arraying: 최대 20개 플레이트 위치

QPix 450: 표준 SBS 플레이트 최대 156개, Stacker당 표준 SBS 플레이트 52개, Stacker 레인당 최대 3개.

QPix 460: 표준 SBS 플레이트 최대 104개, Stacker당 표준 SBS 플레이트 52개, Stacker 레인당 최대 2개.

자동으로 구성과 확장이 가능합니다. 플레이트 수에 제한이 없습니다.

완료

Stacker 레인 2개 또는 3개

플레이트 호텔

수동 개입 없음:
15cm 페트리 접시 1개,
9cm 페트리 접시 5개,
OmniTray 2개,
22cm QTray 1개

수동 개입 없음:
15cm 페트리 접시 2개,
9cm 페트리 접시 10개,
OmniTray 4개,
22cm QTray 2개

자동화 모드:
1-well Omnitray,
8-well Omnitray
Manual mode:
QTray
페트리 접시
OmniTray
SBS 플레이트

1회당 25분 - 12가 가득 찬 이후에만 교체 대상 플레이트로 돌아갑니다.

QPix 450: 플레이트 156개 x 플레이트당 콜로니 96개 = 4.5시간 후에 피킹한 콜로니 14,976개

QPix 460: 플레이트 104개 x 플레이트당 콜로니 96개 = 3시간 후에 피킹한 콜로니 9,984개

전체 실행 시간

최신 자료

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QPix 400 시리즈 미생물 콜로니 피커의 응용 분야

  • 항생물질 억제 영역

    항생물질 영역에 대한 QPix 소프트웨어의 사용

    대상 박테리아 균주에 대한 항생물질을 생산하는 박테리아 균주의 효과는 박테리아 층에서 생성되는 항균 영역의 크기로 측정할 수 있습니다. QPix 소프트웨어로 항균 영역을 생성하는 미생물 콜로니를 빠르게 식별, 순위화, 피킹할 수 있습니다. 지능형 이미지 분석으로 박테리아 층 내 항균 영역과 콜로니 크기, 할로 직경, 밀집도에 기반한 순위를 측정할 수 있습니다.

    바이오연료

    QPix 콜로니 피커로 바이오연료 검출

    가장 두드러진 대체 에너지 자원 중 하나는 바이오디젤로, 에너지가 풍부한 휴대용 연료로 주로 트리아실글리세롤로 구성되어 있습니다. 지질을 생산하는 미생물계의 바이오디젤 생산은 BCA(bicinchoninic acid) assay, 광학밀도 측정, 기체 크로마토그래피 assay와 같은 다수의 시험을 통한 수천 개의 클론 스크리닝을 포함합니다. QPix 콜로니 피커는 시간과 노력이 많이 필요하며 오류가 발생하기 쉬운 과정인 콜로니 피킹 작업을 자동화하여, 적합한 후보를 찾기 위한 타임라인을 효과적으로 단축합니다.

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  • 청색-백색 스크리닝

    QPix 400 청색-백색 스크리닝

    클론 유전자가 삽입된 재조합 플라스미드를 포함한 박테리아 형질전환체의 스크리닝은 분자 클로닝의 필수적인 단계... ‘청색-백색 스크리닝’이라고 불리는 비색 리포터는 재조합 및 비재조합 Colony를 색상에 따라 편리하게 식별할 수 있도록 합니다. QPix Colony 피커는 형질전환 효율성을 효과적으로 모니터링하는 백색광 이미징을 이용하여 정확한 청색-백색 비색 스크리닝을 위해 특별히 설계된 자동화 솔루션을 제공합니다. 이 시스템에 ‘적색-백색 스크리닝’과 같은 다른 비색 접근법도 도입할 수 있습니다. 

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    DNA 시퀀싱

    QPix DNA 시퀀싱

    시퀀싱은 하나의 DNA 분자 내에서 아데닌(A) 구아닌(G) 시토신(C), 티민(T) 뉴클레오티드의 정확한 순서를 판독하는 것입니다. 샷건 시퀀싱은 DNA가 1 킬로베이스의 조각으로 분절되어 원형 플라스미드로 서브 클로닝된 뒤 박테리아로 형질 전환되는 방법입니다. 자동화 콜로니 피킹은 시퀀싱을 위한 플라스미드 분리와 처리량 증가에 필수적입니다. QPix 콜로니 피커는 신뢰성과 정확성으로 잘 알려져 있으며, 사람 유전체 프로젝트 도중 여러 시퀀싱 연구센터에서 사용되었습니다. 백신 개발과 같은 여러 연구 분야에서는 기존의 시퀀싱 기법을 계속 활용하고 있습니다.

    Application Note 자세히 보기 

  • 단클론항체(mAb)

    단클론항체(mAb)

    단일클론항체(mAb)는 하나의 고유 부모 세포에서 유래하기 때문에 단일 에피토프에만 결합됩니다. Monoclonality Antibody 발굴은 일반적으로 코로나19의 코로나바이러스와 같은 질병의 진단 및 치료를 위해 특정 에피토프를 표적으로 하는 특이 항체의 스크리닝과 식별을 말합니다.

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    파지 디스플레이

    QPix 콜로니 피커 파지 디스플레이 기법

    파지 디스플레이는 대상 단백질과 단백질, 펩타이드 또는 DNA의 상호작용을 연구할 수 있는 기법입니다. 이 분자 도구는 바이러스 외피 내부에 표적 단백질을 부호화하는 DNA를 포함하며, 바이러스 외피 외부에 표적 단백질 표지하는 박테리오파지를 사용하여 고친화성의 결합체를 발굴할 수 있도록 합니다. 생성된 파지 디스플레이는 고처리량 방식으로 펩티드 또는 단백질 라이브러리와의 결합을 통해 스크리닝될 수 있습니다. QPix 콜로니 피커는 파지 디스플레이 워크플로에서의 자동화 접종, 플레이팅, 스프레딩, 피킹에 사용될 수 있습니다.  

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  • 단백질 진화

    미생물 콜로니 피커 단백질 진화

    단백질 진화는 시간에 따른 단백질 모양, 기능, 조성의 변화를 설명합니다. 단백질의 유도 진화는 산업용, 연구용, 치료 응용 분야에 사용되는 고분자 활성의 변이 또는 개선을 위한 효과적인 전략으로 입증되었습니다. 다중 형광 필터를 이용한 이 시스템은 다양한 형광 클로닝 벡터와 호환 가능합니다. 따라서 QPix 콜로니 피커는 단백질 접힘, 효소 진화, 단백질 위치를 연구할 때 개별 콜로니에 대한 고유한 정보를 밝혀낼 수 있습니다. 여기에는 형질 전환 표지자를 찾고 돌연변이를 스크리닝하는 것이 포함됩니다.

    합성 생물학

    합성 생물학

    합성생물학은 넓은 의미의 용어로 유전적 경로를 조작하여 기존 Biological System의 힘을 새로운 방식(보통 분자 또는 단백질 제조)으로 활용합니다. 합성생물학은 특히 공학에서 유래한 설계-합성-테스트-학습 주기 원리를 Biological System에 적용합니다. High-Throughput 실험과정을 활용하여 합성생물학자들이 이 과정을 가속화할 수 있습니다.

    자세히 알아보기 

QPix 400 시리즈 미생물 콜로니 피커의 규격과 옵션

QPix 400 시리즈 미생물 콜로니 피커 자료

프레젠테이션
동영상 및 웨비나
분자 복제 및 균주 제조 응용 분야 자동화를 위한 조언

분자 복제 및 균주 제조 응용 분야 자동화를 위한 조언

QPix 데모 영상

QPix 데모 영상

Edinburgh Genome Foundry

Edinburgh Genome Foundry에서 사용 중인 QPix 보기

면역학과 백신 개발 워크플로

면역학과 백신 개발 워크플로

SynBioBeta - QPix 패널 논의(2020)

SynBioBeta - QPix 패널 논의(2020)

플라크 피킹

플라크 피킹

메타지노믹스 계통 발생적 분석

합성 메타지노믹스: 디지털 정보를 다시 생물학으로 전환

QPix 400

QPix 400

  • Citation
    Dated: Oct 28, 2014
    Publication Name: Front. Microbiol

    Impact of interspecific interactions on antimicrobial activity among soil bacteria

    Certain bacterial species produce antimicrobial compounds only in the presence of a competing species. However, little is known on the frequency of interaction-mediated induction of antibiotic compound production in natural communities of soil bacteria. Here we developed a high-throughput method to screen for the production of antimicrobial… View more

    Certain bacterial species produce antimicrobial compounds only in the presence of a competing species. However, little is known on the frequency of interaction-mediated induction of antibiotic compound production in natural communities of soil bacteria. Here we developed a high-throughput method to screen for the production of antimicrobial activity by monocultures and pair-wise combinations of 146 phylogenetically different bacteria isolated from similar soil habitats. Growth responses of two human pathogenic model organisms, Escherichia coli WA321 and Staphylococcus aureus 533R4, were used to monitor antimicrobial activity. From all isolates, 33% showed antimicrobial activity only in monoculture and 42% showed activity only when tested in interactions. More bacterial isolates were active against S. aureus than against E. coli. The frequency of interaction-mediated induction of antimicrobial activity was 6% (154 interactions out of 2798) indicating that only a limited set of species combinations showed such activity. The screening revealed also interaction-mediated suppression of antimicrobial activity for 22% of all combinations tested. Whereas all patterns of antimicrobial activity (non-induced production, induced production and suppression) were seen for various bacterial classes, interaction-mediated induction of antimicrobial activity was more frequent for combinations of Flavobacteria and alpha- Proteobacteria. The results of our study give a first indication on the frequency of interference competitive interactions in natural soil bacterial communities which may forms a basis for selection of bacterial groups that are promising for the discovery of novel, cryptic antibiotics.

    Contributors: Olaf Tyc, Marlies van den Berg, Saskia Gerards, Johannes A. van Veen, Jos M. Raaijmakers, Wietse de Boer, and Paolina Garbeva  
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  • Citation
    Dated: Mar 19, 2004
    Publication Name: The Journal of Biological Chemistry

    Improved Catalytic Efficiency and Active Site Modification of 1,4-β-D-Glucan Glucohydrolase A from Thermotoga neapolitana by Directed Evolution*

    Thermotoga neapolitana 1,4-β-D-glucan glucohydrolase A preferentially hydrolyzes cello-oligomers, such as cellotetraose, releasing single glucose moieties from the reducing end of the cello-oligosaccharide chain. Using directed evolution techniques of error-prone PCR and mutant library screening, a variant glucan glucohydrolase has been isolated… View more

    Thermotoga neapolitana 1,4-β-D-glucan glucohydrolase A preferentially hydrolyzes cello-oligomers, such as cellotetraose, releasing single glucose moieties from the reducing end of the cello-oligosaccharide chain. Using directed evolution techniques of error-prone PCR and mutant library screening, a variant glucan glucohydrolase has been isolated that hydrolyzes the disaccharide, cellobiose, at a 31% greater rate than its wild type (WT) predecessor. The mutant library, expressed in Escherichia coli, was screened at 85 °C for increased hydrolysis of cellobiose, a native substrate rather than a chromogenic analog, using a continuous, thermostable coupled enzyme assay. The Vmax for the mutant was 108 ± 3 units mg-1, whereas that of the WT was 75 ± 2 units mg-1. The Km for both proteins was nearly the same. The kcat for the new enzyme increased by 31% and its catalytic efficiency (kcat/Km) for cellobiose also rose by 31% as compared with the parent. The nucleotide sequence of two positive clones and two null clones identified 11 single base shifts. The nucleotide transition in the most active clone caused an isoleucine to threonine amino acid substitution at position 170. Structural models for I170T and WT proteins were derived by sequence homology with Protein Data Bank code 1BGA from Paenibacillus polymyxa. Analysis of the WT and I170T model structures indicated that the substitution in the mutant enzyme repositioned the conserved catalytic residue Asn-163 and reconfigured entry to the active site.

    Contributors: James K. McCarthy, Aleksandra Uzelac, Diane F. Davis and Douglas E. Eveleigh  
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  • Citation
    Dated: Aug 21, 2003
    Publication Name: the plant journal

    The transcriptional response of Arabidopsis to genotoxic stress – a high‐density colony array study (HDCA)

    A genome‐wide transcription profiling of Arabidopsis upon genotoxic stress has been performed using a high‐density colony array (HDCA). The array was based on a library of 27 000 cDNA clones derived from Arabidopsis cells challenged with bleomycin plus mitomycin C. The array covers more than 10 000 individual genes (corresponding to at least 40%… View more

    A genome‐wide transcription profiling of Arabidopsis upon genotoxic stress has been performed using a high‐density colony array (HDCA). The array was based on a library of 27 000 cDNA clones derived from Arabidopsis cells challenged with bleomycin plus mitomycin C. The array covers more than 10 000 individual genes (corresponding to at least 40% of Arabidopsis genes). After hybridisation of the HDCA with labelled cDNA probes obtained from genotoxin‐treated (bleomycin plus mitomycin C, 6 h) and untreated seedlings, 39 genes revealed an increased and 24 genes a decreased expression among the 3200 highly expressed clones (representing approximately 1200 individual genes because of redundancy of the cDNA library). Of the 4900 clones with a low transcriptional level, the expression of 500 clones was found to be altered and 57 genes with increased and 22 genes with decreased expression were identified by sequence analysis of 135 identified clones. The HDCA results were validated by real‐time PCR analysis. For about 80% of genes (34 out of 42), alteration in expression was confirmed, indicating the reliability of the HDCA for transcription profiling. DNA damage and stress‐responsive genes encoding, for instance transcription factors (myb protein and WRKY1), the ribonucleotide reductase small subunit (RNR2), thymidine kinase (TK), an AAA‐type ATPase, the small subunit of a DNA polymerase and a calmodulin‐like protein were found to be strongly upregulated. Also, several genes involved in cell cycle regulation revealed significant alteration in transcription, as detected by real‐time PCR analysis, suggesting disturbance of cell cycle progression by mutagen treatment.

    Contributors: I‐Peng Chen, Urs Haehnel, Lothar Altschmied, Ingo Schubert, Holger Puchta  
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