연구팀은 MetaMorph 현미경 자동화 및 이미지 분석 소프트웨어를 사용하여 스캔 시간을 88% 단축했습니다.
기업/대학교
하버드 의과대학 브리검 여성병원 병리학과 점막장벽병리학 연구실
팀 구성원
Jerrold R. Turner, M.D., Ph.D., 병리학 및 의학 교수
Shabnam Abtahi, MD 박사후 연구원
사용한 제품
MetaMorph® 현미경 자동화 및 이미지 분석 소프트웨어
도전
솔루션
Molecular Devices의 도움으로 Turner 박사 연구팀은 스캔 슬라이드 모듈을 통합한 맞춤형 저널 세트를 개발하여, 사용자 안내 통합 작업 표시줄을 통해 액세스할 수 있으며 협업할 수 있도록 하였습니다. 이 프로토콜은 다음을 허용합니다.
- 다중 관심 영역(ROI)의 자동 스캔
- ROI 선택 지원
- 안정적인 맞춤형 소프트웨어 기반 포커싱
- 미리보기 이미지를 간단하며 반자동 방식으로 신속하게 검토
- 고품질 이미지의 자동화 스티칭
그 결과, Turner 박사 연구팀은 5개 채널에서 염색된 3 mm의 조직 중심부 슬라이드 40개의 20배 대물렌즈 스캔을 이제 4시간 이내로 완료할 수 있습니다. Turner 박사는 다음과 같이 설명합니다. “이것은 현미경 기반의 상용 시스템과 비교할 때 더 좋은 점이 많습니다. 이 시스템은 MetaMorph에 의해 실행되므로 imaging 방식, 사용된 대물렌즈, 조명원, 필터 및 카메라를 포함한 시스템의 모든 측면을 전체적으로 유연하게 변경할 수 있습니다. 예를 들어, 최근에는 전환 가능한 광원(Lumencore Aura III), 전동 Emission 필터 휠(Ludl) 및 다중 채널 이색성(Semrock)을 추가하여 현미경의 필터 큐브를 변경하는 동안 손실되는 시간을 없앴습니다(변경 1회당 \약 1초). 이로써 imaging 시간이 1시간 단축되었습니다.”
MetaMorph 현미경 자동화 및 이미지 분석 소프트웨어[단종]
사용한 제품
MetaMorph® 현미경 자동화 및 이미지 분석 소프트웨어는 자동화 현미경 획득, 장치 제어, 이미지 분석의 업계 표준으로, 25년 이상 현미경 전문가들이 세포의 Morphology, 기능, 거동을 더 잘 이해할 수 있도록 해 왔습니다. 이 소프트웨어는 획득한 이미지의 의미 있는 분석을 수행하기 위해 필요한 모든 도구를 제공하면서, 동일하지 않은 형광 현미경의 하드웨어와 주변 장치를 단일 맞춤형 워크스테이션에 쉽게 통합하는 ‘접착제'로 적합합니다. 소프트웨어는 세포신호전달 등 생물학에 특화된 분석을 위한 여러 가지 사용자 친화적인 응용 분야 모듈을 제공합니다.
결과
- 이 시스템을 통해 연구자들은 실험용 마우스(Graham 외., 2019; Kuo 외, 2019; Nalle 외, 2019; Raju 외, 2020)와 인간 생검(Turner, 2020)에서 많은 수의 조직 마이크로어레이를 스캔할 수 있습니다.
- 5,000개가 넘는 이미지가 공개적으로 접근 가능한 장 수송 지도서(Atlas of Intestinal Transport)(https://jrturnerlab.com/database-viewer/atlas-of-intestinal-transport/)로 편집되었습니다.
- 학술지와 현행 프로토콜 출판물(Abtahi 외, 2021) 및 교육용 비디오를 https://jrturnerlab.com/publication/a-simple-method/에서 보거나 다운로드